上海市精神卫生研究所成立于1981年3月，设有药物依赖、生化、遗传、神经电生理、脑电影像、心理测量、临床流行病学、儿少行为、心理咨询与治疗、司法精神医学、精神护理、危机干预等14个研究室，主要从事精神医学的临床应用研究。近十余年来，荣获国家级、省部级和局级科研成果奖共23项。目前作为上海市医学重点学科有：上海市精神疾病临床医学中心、老年精神医学、预防精神医学。
中心作为上海交通大学医学院附属医院和复旦大学上海医学院、同济大学医学院、上海中医药大学的教学医院，拥有精神病与精神卫生学博士、硕士点、博士后工作站，心理学硕士点。同时也是上海师范大学、华东师范大学的心理学教学研究与实践基地。作为WHO精神卫生研究与培训合作中心之一，与世界各国的精神医学界进行着广泛的学术交流及科研合作。
受卫生部委托，中心每年举办全国精神科医师、护理进修班和研修班等继续教育项目，培养了大批精神科医疗、护理骨干。心理咨询与治疗培训中心为全国各地培训高质量的心理咨询师和心理治疗师，已形成独特的品牌。自2009年起，中心成为上海市首批住院医师规范化培训基地
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